Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MARCKSP29966 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MARCKSP29966 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms