Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CD40LGP29965 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CD40LGP29965 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms