Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CTGFP29279 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTGFP29279 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTGFP29279 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTGFP29279 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CTGFP29279 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTGFP29279 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTGFP29279 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms