Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB4P28070 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms