Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA3P26006 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms