Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RFX1P22670 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RFX1P22670 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RFX1P22670 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX1P22670 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RFX1P22670 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX1P22670 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX1P22670 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX1P22670 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX1P22670 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX1P22670 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX1P22670 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX1P22670 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX1P22670 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX1P22670 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX1P22670 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX1P22670 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX1P22670 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RFX1P22670 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RFX1P22670 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RFX1P22670 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms