Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF3P18847 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF3P18847 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF3P18847 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF3P18847 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF3P18847 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF3P18847 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF3P18847 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF3P18847 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF3P18847 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF3P18847 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF3P18847 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF3P18847 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF3P18847 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF3P18847 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF3P18847 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF3P18847 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF3P18847 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATF3P18847 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATF3P18847 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATF3P18847 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF3P18847 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF3P18847 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF3P18847 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF3P18847 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF3P18847 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF3P18847 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF3P18847 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF3P18847 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF3P18847 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATF3P18847 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATF3P18847 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms