Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB3P16520 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB3P16520 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB3P16520 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB3P16520 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB3P16520 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB3P16520 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB3P16520 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GNB3P16520 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GNB3P16520 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GNB3P16520 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GNB3P16520 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB3P16520 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB3P16520 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB3P16520 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB3P16520 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB3P16520 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GNB3P16520 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms