Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM27P14373 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM27P14373 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms