Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TNNT1P13805 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TNNT1P13805 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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