Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SKIP12755 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SKIP12755 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIP12755 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIP12755 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIP12755 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SKIP12755 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SKIP12755 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SKIP12755 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SKIP12755 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms