Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TOP2AP11388 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
TOP2AP11388 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms