Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TOP1P11387 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1P11387 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1P11387 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1P11387 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1P11387 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1P11387 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1P11387 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1P11387 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1P11387 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1P11387 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1P11387 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1P11387 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1P11387 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TOP1P11387 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOP1P11387 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TOP1P11387 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TOP1P11387 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TOP1P11387 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms