Protein–RNA interactions for Protein: P11362

FGFR1, Fibroblast growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR1P11362 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FGFR1P11362 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FGFR1P11362 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms