Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PGA3P0DJD8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PGA3P0DJD8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms