Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPRCP08575 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRCP08575 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
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