Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB1P08034 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB1P08034 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB1P08034 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GJB1P08034 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GJB1P08034 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms