Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPM2P07951 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPM2P07951 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPM2P07951 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPM2P07951 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPM2P07951 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms