Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
POLR3DP05423 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
POLR3DP05423 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms