Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APOC1P02654 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APOC1P02654 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOC1P02654 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC1P02654 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC1P02654 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC1P02654 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC1P02654 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC1P02654 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOC1P02654 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOC1P02654 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOC1P02654 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms