Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LTAP01374 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
LTAP01374 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LTAP01374 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LTAP01374 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LTAP01374 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LTAP01374 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LTAP01374 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LTAP01374 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LTAP01374 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LTAP01374 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LTAP01374 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LTAP01374 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LTAP01374 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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