Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EGFRP00533 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EGFRP00533 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
EGFRP00533 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EGFRP00533 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EGFRP00533 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EGFRP00533 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms