Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSD2O96028 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSD2O96028 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSD2O96028 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSD2O96028 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NSD2O96028 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NSD2O96028 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NSD2O96028 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NSD2O96028 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
NSD2O96028 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
NSD2O96028 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
NSD2O96028 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NSD2O96028 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NSD2O96028 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
NSD2O96028 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NSD2O96028 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NSD2O96028 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSD2O96028 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSD2O96028 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSD2O96028 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSD2O96028 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NSD2O96028 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NSD2O96028 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSD2O96028 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSD2O96028 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSD2O96028 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NSD2O96028 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NSD2O96028 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NSD2O96028 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms