Protein–RNA interactions for Protein: O95985

TOP3B, DNA topoisomerase 3-beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BO95985 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TOP3BO95985 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms