Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLIT2O94813 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLIT2O94813 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms