Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GADD45BO75293 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms