Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMARCA5O60264 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA5O60264 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms