Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SOX15O60248 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SOX15O60248 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.6 ms