Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EXTL3O43909 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms