Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDIL3O43854 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms