Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HTATSF1O43719 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HTATSF1O43719 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms