Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CBFA2T2O43439 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms