Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CTIFO43310 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CTIFO43310 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTIFO43310 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTIFO43310 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTIFO43310 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTIFO43310 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTIFO43310 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTIFO43310 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTIFO43310 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTIFO43310 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTIFO43310 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CTIFO43310 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CTIFO43310 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTIFO43310 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTIFO43310 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTIFO43310 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTIFO43310 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CTIFO43310 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CTIFO43310 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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