Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PLXNB1O43157 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms