Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CUX2O14529 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CUX2O14529 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CUX2O14529 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CUX2O14529 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CUX2O14529 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CUX2O14529 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
CUX2O14529 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CUX2O14529 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CUX2O14529 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CUX2O14529 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CUX2O14529 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CUX2O14529 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CUX2O14529 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CUX2O14529 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CUX2O14529 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CUX2O14529 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CUX2O14529 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CUX2O14529 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CUX2O14529 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CUX2O14529 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CUX2O14529 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CUX2O14529 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CUX2O14529 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CUX2O14529 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
CUX2O14529 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CUX2O14529 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CUX2O14529 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CUX2O14529 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
CUX2O14529 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CUX2O14529 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
CUX2O14529 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
CUX2O14529 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CUX2O14529 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CUX2O14529 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CUX2O14529 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC33.81■■■■□ 3
CUX2O14529 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CUX2O14529 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CUX2O14529 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CUX2O14529 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CUX2O14529 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CUX2O14529 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CUX2O14529 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
CUX2O14529 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CUX2O14529 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
CUX2O14529 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CUX2O14529 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CUX2O14529 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC33.8■■■■□ 3
CUX2O14529 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
CUX2O14529 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CUX2O14529 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CUX2O14529 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
CUX2O14529 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
CUX2O14529 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CUX2O14529 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CUX2O14529 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CUX2O14529 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CUX2O14529 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CUX2O14529 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CUX2O14529 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
CUX2O14529 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC33.79■■■■□ 3
CUX2O14529 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
CUX2O14529 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CUX2O14529 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CUX2O14529 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CUX2O14529 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CUX2O14529 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CUX2O14529 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
CUX2O14529 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
CUX2O14529 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
CUX2O14529 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
CUX2O14529 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CUX2O14529 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CUX2O14529 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CUX2O14529 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CUX2O14529 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CUX2O14529 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CUX2O14529 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
CUX2O14529 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CUX2O14529 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CUX2O14529 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CUX2O14529 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CUX2O14529 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC33.77■■■■□ 3
CUX2O14529 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CUX2O14529 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC33.76■■■■□ 3
CUX2O14529 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms