Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BHLHE40O14503 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
BHLHE40O14503 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms