Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PODXLO00592 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PODXLO00592 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PODXLO00592 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PODXLO00592 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PODXLO00592 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms