Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PIK3C2AO00443 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PIK3C2AO00443 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms