Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
APOC4-APOC2K7ER74 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms