Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLDN34H7C241 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms