Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L11C9JVI0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L11C9JVI0 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L11C9JVI0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
USP17L11C9JVI0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L11C9JVI0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L11C9JVI0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L11C9JVI0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L11C9JVI0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L11C9JVI0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L11C9JVI0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
USP17L11C9JVI0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms