Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP17L12C9JPN9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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