Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KRBOX1C9JBD0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KRBOX1C9JBD0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms