Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CENPBD1B2RD01 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms