Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NOTOA8MTQ0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms