Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEURL1BA8MQ27 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEURL1BA8MQ27 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms