Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CYSRT1A8MQ03 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CYSRT1A8MQ03 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms