Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC144AA2RUR9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC144AA2RUR9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms