Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POTEB3A0JP26 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POTEB3A0JP26 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms