Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 OR7A11P-201ENST00000597719 953 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00598-209ENST00000635966 1148 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL359694.2-201ENST00000567753 1615 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP248-201ENST00000516278 305 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC005544.1-201ENST00000584277 460 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
SH3BP1Q9Y3L3 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms